Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gli1P47806 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gli1P47806 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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