Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms