Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms