Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms