Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc11P31313 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms