Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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