Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VtnP29788 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VtnP29788 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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