Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
BgnP28653 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BgnP28653 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BgnP28653 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BgnP28653 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BgnP28653 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
BgnP28653 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BgnP28653 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
BgnP28653 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BgnP28653 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BgnP28653 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BgnP28653 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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