Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ggta1P23336 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms