Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SftpcP21841 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms