Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Pantr1-211ENSMUST00000186656 647 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Prdm6-202ENSMUST00000115398 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prim1P20664 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms