Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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