Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VimP20152 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VimP20152 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VimP20152 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VimP20152 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VimP20152 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VimP20152 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VimP20152 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VimP20152 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VimP20152 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VimP20152 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VimP20152 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VimP20152 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VimP20152 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VimP20152 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VimP20152 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VimP20152 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VimP20152 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VimP20152 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VimP20152 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VimP20152 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VimP20152 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VimP20152 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VimP20152 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VimP20152 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VimP20152 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VimP20152 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VimP20152 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VimP20152 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VimP20152 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VimP20152 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VimP20152 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VimP20152 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VimP20152 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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