Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms