Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms