Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Rcan2-201ENSMUST00000044792 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms