Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
OtcP11725 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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OtcP11725 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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OtcP11725 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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OtcP11725 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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OtcP11725 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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OtcP11725 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
OtcP11725 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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OtcP11725 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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OtcP11725 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
OtcP11725 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
OtcP11725 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
OtcP11725 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
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OtcP11725 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
OtcP11725 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtcP11725 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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OtcP11725 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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OtcP11725 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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OtcP11725 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtcP11725 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtcP11725 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtcP11725 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtcP11725 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtcP11725 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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OtcP11725 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtcP11725 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtcP11725 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtcP11725 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtcP11725 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtcP11725 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
OtcP11725 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtcP11725 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
OtcP11725 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
OtcP11725 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtcP11725 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
OtcP11725 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtcP11725 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
OtcP11725 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
OtcP11725 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms