Protein–RNA interactions for Protein: P01904

H2-Ea, H-2 class II histocompatibility antigen, E-D alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-EaP01904 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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H2-EaP01904 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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H2-EaP01904 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-EaP01904 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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