Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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BckdkO55028 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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BckdkO55028 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms