Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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