Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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DffaO54786 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DffaO54786 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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