Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms