Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Atf6bO35451 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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Atf6bO35451 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atf6bO35451 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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