Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms