Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm2888K7N746 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm2888K7N746 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm2888K7N746 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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