Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms