Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
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