Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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