Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Zfp988F6VKC7 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Zfp988F6VKC7 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Zfp988F6VKC7 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Zfp988F6VKC7 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Zfp988F6VKC7 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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