Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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