Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rd3lB2RV38 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rd3lB2RV38 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rd3lB2RV38 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rd3lB2RV38 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rd3lB2RV38 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rd3lB2RV38 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rd3lB2RV38 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rd3lB2RV38 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rd3lB2RV38 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Rd3lB2RV38 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Rd3lB2RV38 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Rd3lB2RV38 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Rd3lB2RV38 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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