Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Ncam1-202ENSMUST00000166811 3088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm38245-201ENSMUST00000191702 2621 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 5830473C10Rik-201ENSMUST00000094615 2308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Aqp7-201ENSMUST00000030136 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Fgf6-201ENSMUST00000000187 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Fcamr-201ENSMUST00000027670 1743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Qars-201ENSMUST00000006838 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Cpt1b-201ENSMUST00000109313 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms