Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GabreA2AMW3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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