Protein–RNA interactions for Protein: A2A588

Krtap1-3, Keratin-associated protein 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-3A2A588 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm8864-201ENSMUST00000118653 1010 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm13377-201ENSMUST00000137984 683 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm11789-205ENSMUST00000148579 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm15419-201ENSMUST00000148654 743 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm22669-201ENSMUST00000158723 318 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Ppp1r11-203ENSMUST00000174711 520 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm20616-201ENSMUST00000177262 716 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm5205-201ENSMUST00000182253 1003 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm28462-201ENSMUST00000185217 374 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm28406-201ENSMUST00000186516 397 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm28348-201ENSMUST00000187833 397 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm29404-201ENSMUST00000187914 397 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm29003-202ENSMUST00000190434 453 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm28313-201ENSMUST00000191411 397 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 1110025M09Rik-201ENSMUST00000192082 855 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm35670-201ENSMUST00000192493 397 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm37656-201ENSMUST00000192673 397 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm37561-201ENSMUST00000195221 368 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm44460-201ENSMUST00000196179 129 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Krtap1-3A2A588 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms