Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms