Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdac5Q9Z2V6 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms