Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Crlf3Q9Z2L7 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Crlf3Q9Z2L7 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Crlf3Q9Z2L7 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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