Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cldn8Q9Z260 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cldn8Q9Z260 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cldn8Q9Z260 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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