Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm14481-201ENSMUST00000117178 629 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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RfxankQ9Z205 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RfxankQ9Z205 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms