Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ilf3Q9Z1X4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms