Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TapbpQ9R233 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms