Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Prg4Q9JM99 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Prg4Q9JM99 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Prg4Q9JM99 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Prg4Q9JM99 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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