Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms