Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Col5a3Q9JLI2 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms