Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms