Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Gm16618-201ENSMUST00000134992 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Lrp1b-212ENSMUST00000204204 798 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Gm35665-201ENSMUST00000206742 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 AV026068-225ENSMUST00000225042 490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnn1Q9EQR3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Klri1-201ENSMUST00000088046 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnn1Q9EQR3 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms