Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Csnk1dQ9DC28 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1dQ9DC28 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms