Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cntd1Q9D995 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms