Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nop56Q9D6Z1 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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