Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms